按照农业部印发的《水生生物然保护区管理工作考核办法》[农渔发（2013）2号]细则，农业部渔政管理局组织有关部门从“日常巡护”、“资源环境监测”、“科普宣传”和“其他管护工作”等4个方面，对全国22处国家级水生生物自然保护区和48处省级水生生物自然保护区进行考核。厦门海洋保护区在满分150分的考核中，以148分的成绩再次位居全国之首，这是我市水生生物自然保护区连续第三年获此殊荣，实现全国年度考核三连冠。